工藤新(xīn )一是全国著名(míng )的高中生侦探，在(zài )一次追查黑衣人犯罪团伙时不(bú )幸被团伙成员发现，击晕后喂了神奇的药(yào )水(shuǐ )，工藤(téng )新一变回了小孩！新一找到了经常帮(bāng )助他的阿笠博士，博士为他度身打造(zào )不(bú )少(shǎo )间(jiān )谍武器。为了防止犯罪团(tuán )伙对(duì )他进行报复，新(xīn )一(yī )决定(dìng )隐姓埋(mái )名，暗中追查他们，希望能得到解药(yào )。一日，新一 的女友毛利(lì )兰来到(dào )了(le )阿笠博士的家寻找男友的下落，被小兰撞(zhuàng )见的新(xīn )一(yī )情急之下编造了自己名叫江户(hù )川柯南，随后柯南寄居在了小兰家。小兰(lán )的父(fù )亲毛利小五郎是一(yī )名私家侦探(tàn )，新一可以籍着和他一起四出办案一起追查黑夜人的下落(luò )。柯(kē )南在小学认识步(bù )美(měi )等小学生，他(tā )们一起组织了一个少年侦探团，向(xiàng )罪(zuì )犯宣战！