工(gōng )藤新一是全国著(zhe )名的高中生(shēng )侦(zhēn )探，在一次追查(chá )黑衣人犯罪团(tuán )伙时不幸被团(tuán )伙成员发现，击晕后喂了神奇的药水，工藤新一变回了小(xiǎo )孩！新(xīn )一找到了(le )经常(cháng )帮(bāng )助他的阿笠博(bó )士，博士为(wéi )他度身打造(zào )不少间谍武器。为了(le )防止犯罪团伙对他进行报复，新一决定隐(yǐn )姓埋名(míng )，暗中追查(chá )他们(men )，希望(wàng )能得到解药。一(yī )日(rì )，新一 的女友毛利兰来到了(le )阿笠博士的家寻找男(nán )友的下落，被小兰撞(zhuàng )见(jiàn )的新一情急(jí )之下编造了自己名叫江户川柯南(nán )，随后(hòu )柯南寄居在了小兰家。小(xiǎo )兰的父亲毛利小五(wǔ )郎(láng )是一名私家侦探，新一可以籍着和他一起四出办案一起追查黑夜人的下(xià )落。柯南在小学认识步美等小学生，他们一起组织了一个少年(nián )侦(zhēn )探团，向罪犯宣战！