工藤新一是全国著名的高(gāo )中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员发现，击晕后喂了神(shén )奇的药水，工藤新一变回了小孩(hái )！新一找到了(le )经常帮助他的阿笠博士(shì )，博(bó )士为他度身(shēn )打(dǎ )造不(bú )少间谍武器。为了防(fáng )止犯罪团伙对他进行报复，新一决定隐姓埋名(míng )，暗中追(zhuī )查(chá )他(tā )们，希望能得到(dào )解药。一日，新一 的(de )女友毛(máo )利兰来到了阿笠博士的家寻找男友的(de )下落，被小兰(lán )撞见的(de )新一情急(jí )之下编造了自己名(míng )叫江户川柯南，随后柯南寄居在了小兰家。小兰(lán )的(de )父亲毛利小五郎是一(yī )名(míng )私家侦探，新一可以籍着和他一起四出办案一起追(zhuī )查(chá )黑(hēi )夜人的下落。柯南在小学认识步美(měi )等(děng )小学生，他们一起(qǐ )组(zǔ )织了一个少年(nián )侦探团，向(xiàng )罪(zuì )犯宣(xuān )战！