工(gōng )藤新一是全国著(zhe )名(míng )的高(gāo )中生侦探，在(zài )一次追查(chá )黑(hēi )衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员发(fā )现，击晕后喂了神奇的药水，工藤新一(yī )变回(huí )了小孩(hái )！新一找到了经常帮助他(tā )的阿笠博士，博(bó )士为他度身打(dǎ )造不(bú )少(shǎo )间谍武器。为了防止犯罪团伙(huǒ )对(duì )他进行(háng )报复，新一(yī )决定隐姓埋名，暗中追查他们，希望能得到解(jiě )药。一日，新一 的女友毛利(lì )兰来到了阿笠博士的(de )家寻找男友的下落，被小(xiǎo )兰撞见的(de )新一情急之下(xià )编(biān )造了自己(jǐ )名叫江户川柯南，随后(hòu )柯南(nán )寄居在了小兰家。小兰的父亲毛利小(xiǎo )五郎(láng )是一(yī )名私家侦探，新一可以籍(jí )着和他一起四出办案一起追(zhuī )查黑夜(yè )人的下落。柯南在小(xiǎo )学认(rèn )识步美等小学生，他们一起组织(zhī )了一个少年侦探团，向(xiàng )罪(zuì )犯宣战！