工藤新一是全国著(zhe )名的高中生侦探，在一次追查(chá )黑衣人(rén )犯罪(zuì )团伙时不幸被团伙(huǒ )成员发现，击晕后喂了(le )神奇的药水，工藤新一变(biàn )回了小(xiǎo )孩！新一找到了经(jīng )常(cháng )帮助他的阿笠博士，博(bó )士为他度身打造不少间谍武器。为了防(fáng )止犯(fàn )罪团(tuán )伙对(duì )他进行报复，新一(yī )决定隐(yǐn )姓(xìng )埋名(míng )，暗中追查他们，希望能得到(dào )解药(yào )。一日，新一 的女友毛利兰来到了阿笠博士的家寻找男友的(de )下(xià )落，被小(xiǎo )兰撞见的新一情(qíng )急之下编造了自己名(míng )叫江户(hù )川柯南，随后柯南寄居在了小兰家。小兰(lán )的父(fù )亲(qīn )毛利小五郎是一名私家侦探，新一(yī )可以籍着(zhe )和他一起四出(chū )办案一起追查黑夜人的下落。柯南在小学认识步美等小(xiǎo )学生，他们一起(qǐ )组织了一个少年侦探团(tuán )，向罪(zuì )犯宣战(zhàn )！