工(gōng )藤新一是全(quán )国著名(míng )的高(gāo )中生侦探，在一次追查(chá )黑衣人犯罪团(tuán )伙时不幸被团(tuán )伙成员发现，击晕后喂了神奇的(de )药水，工藤新一变回了小孩(hái )！新(xīn )一找(zhǎo )到了(le )经常帮助他的阿笠博士，博士为他度身打(dǎ )造(zào )不少间谍武器。为(wéi )了防(fáng )止犯罪团伙对他进行报(bào )复，新一决(jué )定隐姓埋名，暗中追查(chá )他们，希望能得到解(jiě )药。一日，新(xīn )一 的女友毛利兰来到(dào )了阿笠博(bó )士的家寻找男友的下(xià )落，被小兰撞见的(de )新(xīn )一情急之下编造了(le )自己名叫江户川柯南，随后柯南寄居在了小兰家。小兰(lán )的(de )父亲毛利小五郎是一名私家侦探，新一可以(yǐ )籍着和(hé )他一起(qǐ )四出办案一起追查黑夜(yè )人的下(xià )落。柯南在小学认识步美等(děng )小学生，他(tā )们一起组织了一个少年侦探团，向罪犯宣战！