工藤新一是全(quán )国著名的高中生(shēng )侦探(tàn )，在一次追查(chá )黑(hēi )衣人犯罪团伙时不(bú )幸被团伙成员发现，击晕后喂了神(shén )奇的药水，工藤新一变回了小孩！新一找到了经常帮助他的阿笠博士，博士为他(tā )度身打造(zào )不少间谍武器。为了防止(zhǐ )犯罪团伙(huǒ )对他进行(háng )报复(fù )，新一决定(dìng )隐姓埋名，暗(àn )中(zhōng )追查(chá )他(tā )们，希望能得到解药。一(yī )日，新一 的女友毛(máo )利兰来到了阿笠博士的家寻找男友的下落，被小兰撞(zhuàng )见的新(xīn )一(yī )情急(jí )之下编造了(le )自己名叫(jiào )江户川柯南，随后(hòu )柯南寄居在了小兰家。小兰的父(fù )亲毛利小五(wǔ )郎是一名私(sī )家侦探，新一可以籍着和他(tā )一起四出办案一(yī )起追查(chá )黑夜人的下(xià )落(luò )。柯南在小学认识步美等小学生，他们一起组织(zhī )了一(yī )个(gè )少年侦探团，向罪犯(fàn )宣战！