工藤(téng )新一是全国著名的高中生侦探，在(zài )一次追(zhuī )查(chá )黑(hēi )衣人犯罪(zuì )团伙时不幸被团伙成员发现，击晕后喂了(le )神(shén )奇的药水，工藤新一变回了小孩！新(xīn )一找到了经常帮助(zhù )他的阿笠博士，博士为(wéi )他度身打造不少(shǎo )间谍(dié )武器。为了防(fáng )止犯罪团伙对他进(jìn )行报复，新一决定隐姓埋名，暗中追查(chá )他们(men )，希望能得到解药。一日，新一 的女友(yǒu )毛利兰来到了阿笠(lì )博士的家寻(xún )找男友(yǒu )的(de )下落，被小兰撞见的新一情急(jí )之下编(biān )造(zào )了自己名叫(jiào )江户川柯南(nán )，随(suí )后柯南寄居在了小兰家。小兰的父亲毛利(lì )小(xiǎo )五郎是一名(míng )私家侦探，新一可(kě )以籍(jí )着和他一(yī )起四出办案一起追查黑夜人的下落。柯南在小学认识步美等小学生，他(tā )们(men )一起组织了(le )一个少年(nián )侦(zhēn )探团，向罪犯宣战！