工藤新一是全(quán )国(guó )著名的高(gāo )中生侦探，在一(yī )次追查黑(hēi )衣人(rén )犯罪团伙时不幸被(bèi )团(tuán )伙成员发现，击晕后喂了神奇的药水，工藤新(xīn )一变回了小孩(hái )！新一找到了经常帮助他的阿笠博士，博士为他度身打造(zào )不少(shǎo )间谍武器(qì )。为了防止犯罪团伙对他进(jìn )行报复，新一决定隐姓(xìng )埋名(míng )，暗中追查他们，希望能得到(dào )解药。一日，新一 的女友(yǒu )毛利兰来到了阿笠博士的家寻找男友的下落，被(bèi )小兰撞见的新一情(qíng )急之下编造了自己名叫(jiào )江户川柯南(nán )，随后柯(kē )南寄居在(zài )了小(xiǎo )兰家。小兰的父亲毛利小五郎是(shì )一名私家侦探，新一可以籍(jí )着和(hé )他一起四出办案(àn )一起追查黑(hēi )夜人的下落。柯南在小学认(rèn )识(shí )步美等小学(xué )生(shēng )，他们(men )一起组织了一个少(shǎo )年侦探团，向罪犯宣(xuān )战！