工藤新一是(shì )全国著名的高中生侦探(tàn )，在一次追查黑衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员发现，击晕后喂(wèi )了(le )神奇的(de )药水(shuǐ )，工藤(téng )新一(yī )变回了小孩(hái )！新一找到了经(jīng )常(cháng )帮(bāng )助(zhù )他的(de )阿笠(lì )博士，博(bó )士为他度身打造不少间谍武器。为了防(fáng )止犯罪团伙对他进行报复，新一决定隐姓埋名，暗中追(zhuī )查他们，希(xī )望能得到解药。一(yī )日，新一 的女(nǚ )友毛利兰来到了阿笠博士的家寻找男(nán )友的下落，被小兰撞见(jiàn )的新一情急之下编造了自己名叫江户川(chuān )柯南，随后柯南寄居在了小(xiǎo )兰家。小兰的父(fù )亲毛利小五郎(láng )是一名(míng )私家侦探，新一可以籍着(zhe )和他一(yī )起四出办(bàn )案一起追查黑(hēi )夜(yè )人的下落。柯南在小学认识步(bù )美等(děng )小学生，他们一起组织(zhī )了一个少年侦(zhēn )探(tàn )团，向罪犯宣战！