工藤(téng )新一是(shì )全国著名(míng )的高中(zhōng )生(shēng )侦探(tàn )，在一次追查黑衣(yī )人犯罪团(tuán )伙时(shí )不幸被团伙成员发现，击(jī )晕后喂了神奇(qí )的药水，工藤新(xīn )一(yī )变(biàn )回了小孩！新一找到了经常帮助他的阿笠博士，博(bó )士为(wéi )他度身打造不少间(jiān )谍武器。为了防止(zhǐ )犯罪团(tuán )伙对他进行(háng )报复，新一决定隐姓埋名，暗中追(zhuī )查他们，希望能得到(dào )解药。一日，新一(yī ) 的女友毛利兰来(lái )到(dào )了阿笠博士的家(jiā )寻找男友的下落，被小兰撞见的新(xīn )一情(qíng )急之下编造了自己名叫江(jiāng )户川柯(kē )南(nán )，随后柯南寄居在了小兰家。小兰(lán )的父(fù )亲毛利小五郎是一名私家侦探，新一可以籍着和他一起四出办案一(yī )起追查(chá )黑夜人的下落。柯南在小学认识步(bù )美等小(xiǎo )学生，他们(men )一(yī )起组织了一个少年(nián )侦探团，向罪(zuì )犯宣战！