工藤新一是全国著(zhe )名(míng )的高中生侦(zhēn )探，在一次追查黑衣人犯罪(zuì )团伙时(shí )不幸被团伙成员发现(xiàn )，击(jī )晕后喂了神(shén )奇(qí )的药水，工藤新一变回了小孩！新一找到了经常帮(bāng )助他的阿笠博士，博士为(wéi )他度身(shēn )打造不少间(jiān )谍武器(qì )。为了防止犯罪团伙对他进行报复，新一决定隐姓埋名，暗中追查(chá )他们，希望能得到(dào )解药。一日，新一(yī ) 的女友毛利(lì )兰来到(dào )了阿笠博士的家寻找男友的(de )下落(luò )，被小(xiǎo )兰撞见的新一情急之(zhī )下编造了(le )自己名叫(jiào )江户川柯(kē )南，随后柯(kē )南寄居在了小兰家。小兰的父亲毛利小(xiǎo )五郎(láng )是一名私家(jiā )侦探(tàn )，新一(yī )可以籍着和他一起四(sì )出办案一(yī )起(qǐ )追查黑(hēi )夜人的下落。柯南在小学认识步美(měi )等小学生，他们一起(qǐ )组织了一个少年侦探(tàn )团，向罪犯宣战！