工藤新一是全国(guó )著名的高(gāo )中生侦探，在一(yī )次追查黑衣人犯罪团伙时(shí )不幸(xìng )被(bèi )团伙(huǒ )成员发现，击晕后喂了神奇的药水，工藤(téng )新一变回了小(xiǎo )孩！新一找到了经常帮助他的阿笠博士，博士为他度身打(dǎ )造(zào )不少间谍武器。为了防止犯罪(zuì )团(tuán )伙(huǒ )对他进行报复，新一决定隐姓埋名，暗中(zhōng )追查(chá )他(tā )们，希望(wàng )能得(dé )到解药。一日，新一 的女友毛利(lì )兰(lán )来(lái )到了阿笠博士的家寻找男(nán )友的下落，被小兰撞见的新一情急之下编造了自(zì )己名叫(jiào )江户川柯南(nán )，随后柯(kē )南寄居在了小兰家。小(xiǎo )兰的(de )父(fù )亲毛利小五郎是一名私(sī )家侦(zhēn )探，新一可以籍(jí )着和他一起(qǐ )四出办案一起追查黑夜人(rén )的下落(luò )。柯南在(zài )小(xiǎo )学认识步美等小学生，他们一起组织了一个少年侦探团，向(xiàng )罪犯宣战！