工藤新(xīn )一是全(quán )国著名的高中生侦探(tàn )，在一次追(zhuī )查黑(hēi )衣人(rén )犯罪团伙(huǒ )时不幸被(bèi )团(tuán )伙(huǒ )成员(yuán )发现，击晕后喂了神奇(qí )的药水，工藤新一变回了小孩！新一(yī )找到了经常帮助他的阿笠(lì )博士，博(bó )士(shì )为他度身打造不少间谍武(wǔ )器。为了防止(zhǐ )犯罪团伙对他进(jìn )行报复，新一决定隐姓埋名，暗中追查他们，希望能得到解药。一日，新一 的女友毛利兰(lán )来到了阿笠(lì )博士的家(jiā )寻找(zhǎo )男友的下(xià )落，被小兰撞见的新(xīn )一(yī )情急(jí )之下编(biān )造了自己名(míng )叫江户川(chuān )柯南，随后柯南寄(jì )居在了小兰家。小兰的父亲毛利小(xiǎo )五郎是一名私家侦探，新一可以籍着和他一起四出办案一起(qǐ )追查(chá )黑夜人的下落。柯南在小学认识步美(měi )等(děng )小(xiǎo )学生(shēng )，他们一起组织了一个少年侦探团(tuán )，向罪犯宣战(zhàn )！