工藤新一是全国(guó )著名(míng )的高中生侦探(tàn )，在(zài )一(yī )次追查黑衣人犯罪团伙时不幸被(bèi )团伙成员发现，击晕后喂了神奇的药水，工(gōng )藤新一变回(huí )了小孩！新一(yī )找到了经常帮助他的阿笠博士，博士为他度身打造不少间谍武器。为了防止(zhǐ )犯罪团伙(huǒ )对(duì )他进行(háng )报复，新一决定隐姓埋名，暗中(zhōng )追查他们，希望能(néng )得到解药。一日，新一 的(de )女友毛利兰来到了阿(ā )笠(lì )博士的家寻(xún )找男(nán )友的(de )下落(luò )，被小兰撞(zhuàng )见的新一情急之下编(biān )造了自己(jǐ )名叫江户川柯南，随后柯南(nán )寄居在了(le )小兰(lán )家(jiā )。小兰的(de )父亲毛利小五郎是一(yī )名(míng )私家侦探，新一(yī )可以(yǐ )籍着(zhe )和他一(yī )起(qǐ )四出(chū )办案一起追查黑夜人的下落。柯南在小学认识步美等小学生，他们一起组织了一个少年(nián )侦探团(tuán )，向罪犯宣战！