工藤新一是全国著(zhe )名的高(gāo )中(zhōng )生侦探，在(zài )一次追查黑衣(yī )人犯罪团(tuán )伙时不幸被团伙成(chéng )员发现(xiàn )，击晕后喂了(le )神奇的药水，工藤新(xīn )一(yī )变回了小孩！新(xīn )一找到(dào )了经常帮助(zhù )他的阿笠博(bó )士，博士为他度身打造不少间(jiān )谍武器(qì )。为了防止犯罪团伙对他进行报复(fù )，新一决(jué )定(dìng )隐姓埋名(míng )，暗中追查他(tā )们，希望能得到解药。一日，新(xīn )一 的(de )女友毛利兰来到了阿笠博(bó )士的家寻找(zhǎo )男友的下落，被小兰撞见的新一情(qíng )急之下编造了自己名叫(jiào )江户川柯南，随后(hòu )柯南寄居在了小兰(lán )家。小兰的父亲毛利小五郎(láng )是一名私家侦探，新一可以(yǐ )籍(jí )着(zhe )和他一起四出办案一起追查黑夜人的下(xià )落。柯南在小学认识步美等小学生，他们一起组织了一个少年侦探团，向(xiàng )罪犯宣战！