工藤新一是全(quán )国著名的高中生侦探(tàn )，在一次追查(chá )黑衣人(rén )犯罪团伙时不幸被团伙成员发现，击晕后喂了神(shén )奇的药水，工藤新(xīn )一变回了小(xiǎo )孩！新一找到了经(jīng )常帮(bāng )助他的阿笠博士，博士为他度身打造不少间(jiān )谍武器。为了防止(zhǐ )犯(fàn )罪团(tuán )伙对(duì )他(tā )进行报复，新一决定(dìng )隐姓埋(mái )名(míng )，暗中(zhōng )追(zhuī )查他们，希(xī )望能得到解药。一日，新一 的(de )女友毛利兰来到了阿笠博(bó )士的家寻找男友的下落，被小兰(lán )撞见的新一情急之下(xià )编造了自己(jǐ )名叫(jiào )江户川柯南，随后柯南寄居在了小兰家。小兰的父(fù )亲毛利小五郎是(shì )一名(míng )私(sī )家侦探，新一可以籍着和他一起(qǐ )四出办案一(yī )起(qǐ )追查黑夜人的下落。柯南在小学认识步美等小学生，他们一起组织了一个少(shǎo )年侦(zhēn )探团，向(xiàng )罪犯宣(xuān )战！