工藤新一是全国著名的高中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员(yuán )发现，击晕(yūn )后喂了神奇的(de )药水(shuǐ )，工藤新一变回了小孩！新一找到了经常帮助他的阿笠博士，博(bó )士为他度身打造不少间(jiān )谍武器。为了防止犯罪团伙对他进行报(bào )复，新一决(jué )定(dìng )隐姓埋名，暗中追查他(tā )们，希望能得到解药。一日，新(xīn )一 的(de )女友毛利兰(lán )来到了阿笠博士的家寻找男友的下落，被小兰撞见的(de )新(xīn )一(yī )情急之(zhī )下编造了(le )自己(jǐ )名(míng )叫江户(hù )川柯南，随后柯南(nán )寄居(jū )在了小兰家。小兰的父亲毛利小五郎(láng )是(shì )一名私(sī )家侦探，新一可以籍着和他一起四出办案(àn )一起追(zhuī )查黑夜人(rén )的下(xià )落。柯南在(zài )小(xiǎo )学(xué )认识步美等小学生(shēng )，他(tā )们一起组织了一个少年侦探团，向罪(zuì )犯宣战！