工藤新一是全国著名的高中生侦(zhēn )探，在一次(cì )追查黑衣(yī )人犯罪团伙时不幸(xìng )被团伙成(chéng )员发现，击晕后喂了神奇的药水，工藤新一变(biàn )回了(le )小孩！新一找(zhǎo )到了经常帮助他的阿(ā )笠博士，博士为他度身打(dǎ )造不少间谍武器(qì )。为了防止犯罪团伙对他进行(háng )报复，新一决定隐姓埋名，暗中追查他们，希望能得到解(jiě )药。一日(rì )，新一(yī ) 的女友毛利兰来(lái )到了阿(ā )笠博(bó )士(shì )的家寻找男友的(de )下落，被(bèi )小兰撞见的新一情急(jí )之下(xià )编(biān )造了自(zì )己名叫江户川柯南，随后柯南寄(jì )居在了(le )小兰家。小兰的父亲毛利小(xiǎo )五郎是一名(míng )私家侦探，新一(yī )可以籍着和他一起四出(chū )办案一起(qǐ )追查黑(hēi )夜人的下(xià )落。柯南在小学认识步(bù )美等(děng )小学生(shēng )，他们一起组织了一个少年(nián )侦探团，向罪(zuì )犯宣战！