工藤新一是全国著(zhe )名的高中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪团伙时(shí )不幸被团伙(huǒ )成员发现，击晕(yūn )后喂了神奇的药水，工藤新一变回了小孩(hái )！新一(yī )找到了经(jīng )常帮助他的阿笠博士(shì )，博士为他度身(shēn )打造不少间(jiān )谍武器。为了防止(zhǐ )犯罪团伙对他(tā )进行报复，新(xīn )一决(jué )定隐姓埋名，暗(àn )中追(zhuī )查他们，希望能得(dé )到解药。一日，新一 的女友毛利兰来到了阿笠博士的家寻找男友的下落，被小(xiǎo )兰(lán )撞见的(de )新(xīn )一情急之(zhī )下编造了(le )自己名叫江户川柯南，随后柯南(nán )寄居在了(le )小兰家(jiā )。小兰的父亲(qīn )毛利小五郎是一名私家侦探，新一可以籍着和他一起四出办案一起(qǐ )追查黑夜人的(de )下落(luò )。柯南在小学认(rèn )识(shí )步美(měi )等小学生，他(tā )们一起组织了一个(gè )少年侦探(tàn )团，向罪犯宣(xuān )战！