工藤(téng )新一是全国著(zhe )名的高(gāo )中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪团(tuán )伙时不幸被(bèi )团伙成员发现，击晕(yūn )后喂了神奇的药水，工藤新一变回(huí )了小孩(hái )！新(xīn )一找到了经(jīng )常帮助他的阿笠博士(shì )，博(bó )士为他度身打(dǎ )造不少(shǎo )间谍武器。为了防止犯罪团(tuán )伙对他进行报(bào )复，新一决定隐姓埋名，暗中追查他们，希望能得到(dào )解(jiě )药。一日，新一 的女友毛利兰来到了阿笠博士(shì )的家寻(xún )找男友的下落，被小兰撞(zhuàng )见的新一情急(jí )之(zhī )下编造(zào )了自己名叫江(jiāng )户川柯南，随后柯南寄居在了小兰家(jiā )。小兰的父亲(qīn )毛(máo )利小五(wǔ )郎(láng )是一名私家侦探(tàn )，新一可以籍着和(hé )他一(yī )起(qǐ )四出办案一起追查黑夜人的下落。柯(kē )南在小学认识步(bù )美等小学生，他们一起组(zǔ )织了一个少年侦探(tàn )团，向罪犯宣战！