工(gōng )藤新一是全国(guó )著名的高中(zhōng )生侦(zhēn )探，在一次追查黑衣人犯罪团伙时不幸被团伙(huǒ )成员发现，击晕后(hòu )喂了神奇的药水，工藤新一变回了小孩(hái )！新一(yī )找到了经常帮助(zhù )他的阿笠(lì )博士(shì )，博士为他度(dù )身(shēn )打造不少间谍武器。为了(le )防(fáng )止犯(fàn )罪(zuì )团伙对他(tā )进行报复，新一决定隐姓埋名，暗中追查(chá )他们，希(xī )望能得到(dào )解(jiě )药。一日，新一 的女友毛利兰(lán )来到了阿笠博士的家(jiā )寻找男友的下落(luò )，被小(xiǎo )兰撞见的新一(yī )情急之下编造了自(zì )己名叫(jiào )江户川柯南，随后柯南寄居在了小兰家(jiā )。小兰(lán )的父(fù )亲(qīn )毛利(lì )小五郎是一名私家侦探，新一(yī )可以籍着(zhe )和他一起(qǐ )四出办案一起追查黑夜人的下落。柯南在小(xiǎo )学认识步(bù )美等小学生，他们一起组织了一个少年侦探团，向罪犯宣战！