工藤新一是全国著名的高中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员发现(xiàn )，击(jī )晕后喂了神(shén )奇的(de )药水，工藤新(xīn )一(yī )变回了小孩！新一找到了经常(cháng )帮助他的阿(ā )笠(lì )博(bó )士，博士为他度身(shēn )打造(zào )不少间谍武器。为了防止犯罪团伙对(duì )他进行(háng )报(bào )复，新一决定隐姓埋名，暗(àn )中追查他们，希望能得到(dào )解药。一(yī )日，新一 的女友毛利兰来(lái )到了阿笠博(bó )士(shì )的家寻找男友的下落，被小兰撞见的新(xīn )一(yī )情急之下(xià )编造了自己名叫江户川柯(kē )南，随后柯南(nán )寄居在了小兰家。小兰的父亲毛利小五郎是(shì )一名私家侦探，新一可以籍(jí )着和他一(yī )起四出(chū )办(bàn )案一起(qǐ )追查黑夜人的下落。柯(kē )南(nán )在小学认识步美(měi )等小学(xué )生，他们(men )一起组织了一个(gè )少年侦(zhēn )探团，向罪犯宣战(zhàn )！