工藤(téng )新一是(shì )全国著名的(de )高中生侦(zhēn )探，在一次(cì )追查黑衣人犯(fàn )罪团伙(huǒ )时(shí )不幸(xìng )被团(tuán )伙成员发现(xiàn )，击晕(yūn )后喂了(le )神奇的药水，工藤新一变回了小(xiǎo )孩(hái )！新一(yī )找到了(le )经常帮助他的阿笠博(bó )士(shì )，博士为他度(dù )身打(dǎ )造不少间谍武器。为了防止犯罪团伙对他(tā )进行报复，新一决定隐姓埋名，暗中追(zhuī )查(chá )他们，希(xī )望能得(dé )到解药。一日，新一 的女友毛利兰来到了阿笠博士的家寻找男友的下落(luò )，被(bèi )小兰撞见的新一情(qíng )急之(zhī )下编造了自己名叫江户川柯南，随后(hòu )柯(kē )南寄居在(zài )了小兰(lán )家。小兰的父亲毛利小五郎是一(yī )名私家侦探，新一(yī )可以籍着和他一起四(sì )出办案一起追查黑夜人的下落。柯(kē )南在小学认识步美等小学生，他们一起(qǐ )组织了一个少年侦探团，向罪犯宣战！