工藤新一是全国著名的高中生侦(zhēn )探(tàn )，在一次追查黑衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员发现(xiàn )，击晕(yūn )后喂了神奇的药水，工藤新一变回了小孩！新一找(zhǎo )到了经常帮助他的阿笠博(bó )士，博士为(wéi )他度(dù )身打造(zào )不少间谍武器。为了防止犯罪团伙(huǒ )对他进行报复，新一决定隐姓埋名(míng )，暗(àn )中追查他(tā )们，希望能得到解药。一日，新(xīn )一(yī ) 的(de )女(nǚ )友(yǒu )毛利兰来到了阿笠博士的(de )家寻(xún )找男友的下落，被小兰(lán )撞(zhuàng )见的新一情急之下编造了自己(jǐ )名叫江户川柯南，随后柯南寄居在(zài )了小兰家(jiā )。小(xiǎo )兰的(de )父亲毛利小五郎是一名私家侦探，新一(yī )可以籍着和(hé )他一(yī )起四出办案一起追查黑夜人的下落。柯南在小(xiǎo )学(xué )认识步美等小(xiǎo )学生，他们一起(qǐ )组织了一个(gè )少年侦探(tàn )团，向罪犯宣战(zhàn )！