工藤新一是全国著名的高中生侦探，在(zài )一次追查黑衣人犯罪团伙时不(bú )幸被团伙成员发现，击晕后喂了神(shén )奇的(de )药水，工藤新(xīn )一(yī )变回(huí )了小孩！新一找到了(le )经常帮助他的阿笠博(bó )士，博士为他(tā )度身打造不少间谍武器。为了防(fáng )止犯罪团伙对他(tā )进(jìn )行报复，新一决定隐姓埋名，暗(àn )中追查他们，希望能得到解药。一日，新一 的女(nǚ )友毛利兰来到了(le )阿笠博(bó )士(shì )的家寻找男友的下落(luò )，被小兰(lán )撞见的(de )新一情急之下编造(zào )了自己(jǐ )名(míng )叫(jiào )江户川(chuān )柯南，随后(hòu )柯南寄居在了小兰家。小兰的父亲毛(máo )利小五郎是一名私(sī )家侦探，新一可以籍着和他(tā )一起四出办案(àn )一起追查黑夜人的(de )下落。柯南在小学认识(shí )步美等小(xiǎo )学生(shēng )，他们一起组(zǔ )织了一个少年侦探团，向罪犯宣(xuān )战(zhàn )！