工(gōng )藤(téng )新一是全国(guó )著(zhe )名的高中生侦(zhēn )探(tàn )，在一次追查黑衣人犯罪团(tuán )伙时不幸被团(tuán )伙成员发现，击晕后喂了(le )神奇的(de )药水，工藤新一变回了小孩(hái )！新一找到了经常帮助(zhù )他的阿(ā )笠博士，博士为他(tā )度身打造不少间(jiān )谍武器。为了防(fáng )止犯罪团伙(huǒ )对他进行报复，新一决定隐(yǐn )姓埋名，暗中追查他(tā )们，希望能得(dé )到解药。一日，新一 的女友毛利兰来到了阿(ā )笠博士(shì )的家寻找(zhǎo )男友(yǒu )的下落，被小兰撞见的新一情急之下编造了自己名(míng )叫江户(hù )川柯南，随后柯南(nán )寄居在了小兰家。小兰的父亲(qīn )毛利小五郎是一名私(sī )家侦探，新一可以籍着(zhe )和他一起四出办案一(yī )起追查黑夜(yè )人的下落。柯(kē )南(nán )在小学认识步美等小学生，他(tā )们一起组(zǔ )织了一个少年侦探团，向罪(zuì )犯(fàn )宣战！