工藤新一是全(quán )国著(zhe )名的高中生侦探，在一次(cì )追查黑(hēi )衣人犯(fàn )罪团(tuán )伙时不幸被团伙成员发现，击晕后喂了神(shén )奇的药水，工藤新(xīn )一变(biàn )回了小(xiǎo )孩！新一(yī )找(zhǎo )到了经常帮助他的(de )阿笠博士，博士为他度身打造不少间谍武器。为了(le )防止犯(fàn )罪团伙对他进行报复(fù )，新一决(jué )定隐姓(xìng )埋名，暗(àn )中追查他们，希望(wàng )能得到解药。一日(rì )，新一 的女友毛利兰来到了(le )阿笠博士的(de )家寻找男友的下落，被小(xiǎo )兰(lán )撞见的新(xīn )一情急之下编造了自己名叫(jiào )江户川柯南，随后柯南寄居在了小兰家。小(xiǎo )兰的父亲毛利小(xiǎo )五郎是一名私家侦(zhēn )探，新一可以籍着和他一起四出办案一起追查黑夜人的下落。柯南在小学(xué )认识步(bù )美等(děng )小(xiǎo )学生，他们一起组(zǔ )织了一个少年(nián )侦探(tàn )团，向(xiàng )罪犯宣战！