工藤(téng )新一是全国著名的(de )高中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪团伙(huǒ )时不幸被团(tuán )伙成员发现(xiàn )，击晕(yūn )后喂(wèi )了神奇的药水(shuǐ )，工藤新一变回了(le )小孩！新一找到了(le )经(jīng )常帮助他的阿笠博士，博士为他度身打造(zào )不少(shǎo )间谍(dié )武器(qì )。为了(le )防止犯罪团(tuán )伙对他进行报复，新(xīn )一决定隐姓埋名，暗中追查他(tā )们，希望能得到解药。一(yī )日，新(xīn )一 的(de )女友毛利(lì )兰来到了阿笠博士的家寻找男友的下落，被小兰撞见的新一情急之(zhī )下(xià )编造(zào )了自己名叫江户川柯(kē )南，随(suí )后(hòu )柯(kē )南寄居在了小(xiǎo )兰家。小兰的父亲毛利小(xiǎo )五郎是一名私家侦探，新一可以籍着和他(tā )一起四出办案一起追查黑(hēi )夜人的下落。柯南在小学认(rèn )识步美等小学生，他们一起组(zǔ )织(zhī )了一(yī )个少年侦探团，向罪犯(fàn )宣战！