工藤(téng )新一是全国著名(míng )的高中生侦探，在一次追查黑衣(yī )人犯罪团伙时不幸被团伙成员发现，击(jī )晕后喂了神奇的药水，工(gōng )藤新一变回了小孩！新一找到(dào )了经常帮(bāng )助他的阿笠博士，博(bó )士为他度身打造不少间谍武器。为(wéi )了(le )防止犯(fàn )罪团伙对他进行报复(fù )，新一决定隐姓埋名(míng )，暗中追查他们，希(xī )望能得到解药。一日，新一 的女友毛利兰来到了阿笠(lì )博士的家寻找男(nán )友(yǒu )的下落(luò )，被小兰撞见的(de )新一情急之下编造了(le )自己名叫江(jiāng )户川柯南，随(suí )后柯(kē )南(nán )寄居在了小兰家(jiā )。小兰的父亲毛利小(xiǎo )五(wǔ )郎是一(yī )名私家侦探(tàn )，新一可以籍着和他(tā )一起四出办案一起追查黑夜人的(de )下落。柯南(nán )在小学认识步(bù )美等小学生，他们(men )一起组织(zhī )了一个少年侦探团，向(xiàng )罪犯宣战！