工藤新一是全国著名(míng )的高(gāo )中生侦探，在(zài )一次追查黑衣(yī )人(rén )犯罪(zuì )团伙时不幸被团伙成员发现(xiàn )，击晕后喂(wèi )了(le )神(shén )奇的药水，工藤新一(yī )变回(huí )了小孩！新一找到了经常(cháng )帮(bāng )助他的阿笠博士，博士为他(tā )度(dù )身打造不少(shǎo )间谍(dié )武器。为了防止犯(fàn )罪(zuì )团伙对他进行报复，新一决定隐姓埋名，暗中追查他们，希望能得到解(jiě )药(yào )。一日(rì )，新一 的女友毛利兰来到了阿(ā )笠博士的家(jiā )寻(xún )找男(nán )友的下落，被小兰撞见的新一情急之下编(biān )造了自己名叫江户川柯南(nán )，随后柯南(nán )寄居在了小(xiǎo )兰家。小(xiǎo )兰的父亲毛利小五郎是(shì )一名私家侦(zhēn )探，新一可以籍着和他一起四出办案一起追(zhuī )查黑夜人(rén )的下落。柯南在小学认(rèn )识步(bù )美等小学生，他们一起组(zǔ )织了一个少年侦探团，向罪犯宣(xuān )战！