工藤新一是全国著名的高中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪团(tuán )伙时不幸(xìng )被团伙成员发现，击晕后喂了神奇的药水，工藤新一变(biàn )回了小(xiǎo )孩！新一(yī )找到(dào )了经常帮助他的阿笠博士(shì )，博士为他度身打(dǎ )造不少间谍武器。为了防(fáng )止犯罪(zuì )团伙对他进行(háng )报复，新一(yī )决定隐姓埋(mái )名，暗中追查(chá )他们，希望能得到(dào )解药。一(yī )日，新(xīn )一 的女(nǚ )友毛(máo )利兰来到了阿笠博士的家寻找男友(yǒu )的下落，被小(xiǎo )兰撞见的新一情急之下编造了自己(jǐ )名叫江户(hù )川柯南，随后柯(kē )南寄居在了小兰家。小兰的父亲毛利小五郎是一名(míng )私家侦探(tàn )，新一可以籍着和他(tā )一起四出办(bàn )案一起追查黑夜(yè )人的下落。柯南在小学(xué )认识(shí )步美等小学生(shēng )，他(tā )们一起组织了(le )一(yī )个少年侦探团，向罪犯宣(xuān )战！