工藤新一是全国著名的高(gāo )中生侦探，在一次追查黑衣人犯(fàn )罪团伙时不幸被团伙成员发现，击晕后喂了神奇的药水，工藤新一变回了小孩！新一(yī )找到了经常(cháng )帮助他的阿笠(lì )博士(shì )，博士为他度身打造(zào )不少间谍武器。为了防止犯罪团伙对他进(jìn )行报(bào )复，新(xīn )一(yī )决定隐姓埋名，暗(àn )中追(zhuī )查他们，希望能(néng )得到解药(yào )。一日(rì )，新(xīn )一 的女友毛利兰来到了阿(ā )笠博士的家寻(xún )找男友(yǒu )的下落，被(bèi )小兰撞(zhuàng )见的(de )新一情急之下编造了自己名叫江户川柯南(nán )，随(suí )后柯南寄居(jū )在了(le )小兰(lán )家(jiā )。小(xiǎo )兰的父亲毛利小五郎是一名(míng )私家侦探(tàn )，新(xīn )一可以(yǐ )籍着和他(tā )一起四出办案一起追查黑夜人的下落。柯南在小学认识步美等小(xiǎo )学生，他们一起组织了一个少(shǎo )年侦探团，向罪犯宣战！