工藤新一(yī )是(shì )全国著名(míng )的高(gāo )中生侦探，在一次(cì )追查黑(hēi )衣人犯罪团伙时不幸被团(tuán )伙成员发现(xiàn )，击晕后喂了(le )神奇的药水，工(gōng )藤新一变回了小孩！新一找到了经(jīng )常帮(bāng )助他的阿笠博士，博士为他度身(shēn )打造(zào )不少间谍武器。为了防止犯罪(zuì )团伙对(duì )他进(jìn )行报复，新一决定(dìng )隐姓埋名，暗中追(zhuī )查他们，希望能得到(dào )解药。一日(rì )，新一 的女友毛利兰(lán )来到了阿笠博士的家寻找男友(yǒu )的下落，被小兰撞见的新一情急之下(xià )编造了(le )自己名叫江户(hù )川(chuān )柯南，随后柯南寄居在了小兰家。小兰的父亲毛利小(xiǎo )五郎是一名私家侦探，新一可以籍(jí )着和他一(yī )起四出办(bàn )案一起追查黑(hēi )夜(yè )人的下落。柯南在小学认识步美等小学生，他们一起组织了一(yī )个少(shǎo )年侦探(tàn )团，向罪犯(fàn )宣战！