工藤新一是全国著名的高中生(shēng )侦(zhēn )探，在一次追查黑衣人犯罪团伙时不(bú )幸被(bèi )团(tuán )伙成员(yuán )发现(xiàn )，击晕后喂了神奇的药水，工藤新一(yī )变回了小孩！新一找到了经常(cháng )帮助他的阿笠(lì )博士，博士为他度身打造不少间谍武(wǔ )器。为了防止犯罪团(tuán )伙对他进行报(bào )复，新一决定隐姓(xìng )埋名(míng )，暗中追查他们(men )，希望能(néng )得到解(jiě )药。一日，新一 的女友毛利兰来到了(le )阿笠(lì )博士的(de )家寻找男友的下落，被小(xiǎo )兰撞见(jiàn )的新一情(qíng )急之(zhī )下编造了自己名叫江户川(chuān )柯南(nán )，随后柯南寄居在了小兰家。小兰的父亲毛利小五郎是一名私家(jiā )侦探，新一可以籍着和(hé )他(tā )一起四出办案一(yī )起追查黑夜(yè )人(rén )的下落(luò )。柯南在小学(xué )认识步美等小学生(shēng )，他们(men )一起组织了一个少年侦(zhēn )探团，向罪犯宣战！