工藤新一是(shì )全国著名(míng )的高中生(shēng )侦探，在一次追(zhuī )查黑(hēi )衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员发现，击(jī )晕后喂(wèi )了神奇(qí )的药水，工(gōng )藤新一变回了小孩！新一(yī )找到了经常帮助他的阿笠博士，博士(shì )为他(tā )度身(shēn )打造不少间谍(dié )武器(qì )。为了防止犯罪团伙对他进行(háng )报(bào )复，新(xīn )一(yī )决(jué )定隐姓(xìng )埋名，暗中追(zhuī )查他们，希(xī )望能得到解药。一日，新一 的女友毛利兰来到了阿笠博士的家寻找男友的下落，被小兰撞见的新一情急之下编造(zào )了(le )自己名叫(jiào )江户川柯南，随后柯南寄居在了小兰家(jiā )。小兰的(de )父亲毛利小五郎是一(yī )名私(sī )家侦探，新一可以籍着(zhe )和他一起四出办(bàn )案一(yī )起追查(chá )黑夜人的下落。柯南在小学认(rèn )识步美等小学生，他们一起(qǐ )组织了一个少年侦探团，向罪犯宣战！