工藤新一是全国(guó )著名的(de )高中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪团(tuán )伙时(shí )不幸被团伙成(chéng )员发现，击晕后(hòu )喂了神奇的药水，工(gōng )藤新(xīn )一变回了小孩！新一找到了经常帮助他的阿笠博士，博士(shì )为他(tā )度身打造不少间(jiān )谍武(wǔ )器。为了防止犯罪团伙(huǒ )对(duì )他进行报复，新一决定隐姓埋名，暗中追查他们，希望能得到解药。一日，新一 的女友毛利兰来到了阿笠博(bó )士(shì )的家寻找(zhǎo )男友的下落，被小兰撞见的新一情急之下(xià )编造了自己名叫江户川柯南，随(suí )后柯南寄居在了小(xiǎo )兰家。小兰(lán )的父亲毛利(lì )小(xiǎo )五郎是一名(míng )私家侦探，新一可以籍着和他一起四出办(bàn )案一起追(zhuī )查黑(hēi )夜人的下落。柯南(nán )在小(xiǎo )学(xué )认(rèn )识步(bù )美等小学生，他们(men )一起组织了一(yī )个少年侦探团，向(xiàng )罪犯宣战(zhàn )！