工藤新一是全(quán )国著名的高中(zhōng )生(shēng )侦(zhēn )探，在一次追查黑衣人犯罪团(tuán )伙时不幸被团伙成员发现，击晕(yūn )后喂了神奇的药水，工藤新一变回了小孩！新一找到了(le )经常帮助他的(de )阿(ā )笠博士，博士为他度身(shēn )打造不少间谍武器。为了防止(zhǐ )犯罪团伙对他进行(háng )报复(fù )，新一决定隐姓埋名(míng )，暗中(zhōng )追查他们，希望能得到解药。一日(rì )，新一 的(de )女友毛利兰(lán )来到了阿(ā )笠(lì )博(bó )士的家(jiā )寻找男友的(de )下(xià )落，被小兰撞见的新一情急(jí )之下编(biān )造了自己名(míng )叫江户川(chuān )柯南，随后柯南寄居在了小兰(lán )家。小兰的父亲毛(máo )利小五郎是一名(míng )私家侦探，新一可以籍(jí )着和他一起四出办案一起追查黑夜(yè )人的下落。柯南在小(xiǎo )学(xué )认识步美等小学生，他们一起组(zǔ )织了一个少年侦探团，向罪犯宣战！