工藤新(xīn )一是全国著名的高中生侦(zhēn )探，在一次(cì )追查黑衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员发现，击晕后喂(wèi )了(le )神奇的药水，工(gōng )藤新一变回了小(xiǎo )孩！新一找到了经(jīng )常(cháng )帮助他的阿笠博士，博士为他度身打造不少间谍武器。为(wéi )了防止(zhǐ )犯(fàn )罪团伙对他进行报复，新一决定隐姓埋名，暗中追查他们，希望(wàng )能得到解药。一(yī )日，新(xīn )一 的女友毛利兰来到了阿笠博士(shì )的家寻找男(nán )友的下落，被小兰撞(zhuàng )见的(de )新一情急(jí )之(zhī )下编造(zào )了自己名叫江户川柯南，随后柯南寄居(jū )在了小兰家。小兰的父亲毛利小五郎是一名私家侦探，新一(yī )可以籍着和他一起四出(chū )办案一(yī )起追查黑夜人(rén )的下落(luò )。柯(kē )南在(zài )小学认(rèn )识(shí )步美等小学生，他们一(yī )起组织了一个少年侦探(tàn )团，向(xiàng )罪犯(fàn )宣战(zhàn )！