工藤新一是全国著名的(de )高中生(shēng )侦(zhēn )探(tàn )，在一次追(zhuī )查黑衣人犯罪团伙(huǒ )时不幸被团伙成员发现，击(jī )晕后喂了神奇的药水，工藤新一(yī )变回(huí )了小孩！新一找到了经常帮助他的(de )阿笠博士，博士为他(tā )度身打(dǎ )造不(bú )少间谍(dié )武器。为了(le )防(fáng )止犯罪(zuì )团伙对他进行报复，新(xīn )一决定(dìng )隐姓埋名，暗中追查他(tā )们，希望(wàng )能得到解药。一日，新一 的女友(yǒu )毛利兰来到了阿笠博士的家寻找男(nán )友的下落，被小兰撞见(jiàn )的新(xīn )一情急之下编造了自己名叫(jiào )江户川柯(kē )南，随后柯南寄(jì )居在(zài )了小兰家(jiā )。小兰的父亲毛利小五郎是一名私家侦探，新一可以籍着和他一起四出办案一(yī )起追(zhuī )查黑夜(yè )人的下(xià )落。柯(kē )南在小(xiǎo )学(xué )认识步美等小学生，他们一(yī )起组(zǔ )织了一个少(shǎo )年侦探团，向罪犯宣战！