工(gōng )藤新一是全国著名的高中生(shēng )侦探，在一次追查(chá )黑衣人犯罪团伙时不(bú )幸被团伙成员(yuán )发现，击晕后喂(wèi )了神奇的药(yào )水，工藤(téng )新一变回了小孩！新一(yī )找到了经常帮助(zhù )他的阿(ā )笠博士，博士(shì )为他度身打造不少间谍武器。为了防止犯罪团(tuán )伙对他进行报复，新一决(jué )定隐姓埋(mái )名，暗中追查他们，希望能得到解(jiě )药。一(yī )日，新一(yī ) 的女友毛利兰来到了阿笠博士的家(jiā )寻(xún )找(zhǎo )男(nán )友的下落，被小(xiǎo )兰撞见的(de )新一情急之下编造了自己名叫江户川柯(kē )南，随后柯南寄居(jū )在了小(xiǎo )兰家。小兰的父亲毛利小五(wǔ )郎是一名私家侦探，新一可以籍着和他一起四出(chū )办案一起追查黑夜(yè )人(rén )的下(xià )落。柯南在小学认识步美等小学生，他(tā )们一起组(zǔ )织了一个(gè )少年侦探团(tuán )，向罪犯(fàn )宣战！