工藤(téng )新一是全国著名的高中生侦探，在一次追查黑衣人犯(fàn )罪团伙时不(bú )幸被团伙成员(yuán )发现(xiàn )，击(jī )晕后(hòu )喂了神奇的药水，工藤新一变回了小孩！新一找(zhǎo )到了经常(cháng )帮助他的阿笠博士，博士为(wéi )他度身打造不少(shǎo )间谍武器。为了防(fáng )止犯(fàn )罪团(tuán )伙对他(tā )进行报复(fù )，新一决定隐姓(xìng )埋名，暗中追查他们，希望能得到解(jiě )药(yào )。一日(rì )，新一 的女友毛利兰来到了阿笠(lì )博士的(de )家寻找男友的下落，被小兰撞见的新一情急之(zhī )下编造了自己名叫江户川柯(kē )南，随后柯南寄(jì )居在了(le )小兰家。小兰的(de )父亲毛利(lì )小(xiǎo )五郎是(shì )一名私家侦探，新一可以籍着和他一(yī )起四出(chū )办案一起(qǐ )追查黑夜人(rén )的下(xià )落。柯(kē )南在小学认识(shí )步美等小学生，他们一起组织了一个(gè )少年侦探团，向罪犯(fàn )宣战！