工藤新一是全国著名的高中生侦探，在(zài )一次追查(chá )黑衣人犯罪团伙时(shí )不幸被团(tuán )伙成员发现，击晕(yūn )后喂(wèi )了(le )神奇的药(yào )水，工藤新一(yī )变回了小(xiǎo )孩(hái )！新一找(zhǎo )到(dào )了经常帮(bāng )助他的阿笠博士，博士为他(tā )度身打造不少间谍武器(qì )。为了防止犯罪团伙对他进行报复，新一决定隐姓(xìng )埋名，暗中追查他们(men )，希望能得到解药。一日，新一(yī ) 的(de )女友毛(máo )利兰来到了阿笠博士的家寻找男(nán )友(yǒu )的下(xià )落，被小兰撞见的新一情急之下编造了(le )自(zì )己名叫江户川柯南，随后柯南寄(jì )居在(zài )了(le )小兰家。小兰的父亲毛利小五郎是一名私家侦探，新一可(kě )以籍着和(hé )他一起四(sì )出办案一(yī )起追查黑夜人的下落。柯南(nán )在小学认识步美等(děng )小学(xué )生，他们一起(qǐ )组织了一(yī )个少年(nián )侦探(tàn )团，向罪犯宣战！