工藤新一是(shì )全国著名(míng )的高(gāo )中生(shēng )侦探，在一次追查黑衣人犯罪团(tuán )伙时(shí )不(bú )幸被团伙成员发(fā )现，击晕后喂了神奇的药(yào )水，工藤新(xīn )一变回了小(xiǎo )孩(hái )！新一找到了经常帮助他(tā )的阿笠博士，博(bó )士(shì )为他度身(shēn )打造不少间谍武器。为了防止犯罪团(tuán )伙对他进行报复，新一决定隐姓埋名(míng )，暗中追查他(tā )们，希望能得到解药。一日(rì )，新一 的女友毛利兰来到了阿笠博士的家寻(xún )找男(nán )友的下落(luò )，被小兰撞见的新一情急(jí )之下编造了自(zì )己名叫江户川柯南，随后柯南寄居在了小兰(lán )家。小兰(lán )的父亲毛(máo )利小五郎是一(yī )名私家侦(zhēn )探，新一可以籍着和他一起(qǐ )四(sì )出办案一起追(zhuī )查黑夜人的下(xià )落(luò )。柯(kē )南在小学认识步美(měi )等小学(xué )生，他们一起组织了一个少年侦探团，向罪犯宣战！