工藤新一是(shì )全国著名的高中生侦探，在一次追查黑衣人犯(fàn )罪团伙时不幸被团伙成员发现，击(jī )晕后喂了神奇(qí )的药水，工藤新一(yī )变回了小孩！新一找到了经(jīng )常帮助他的阿笠博士，博(bó )士为(wéi )他度身打造不少间谍武器。为了防止(zhǐ )犯罪团伙(huǒ )对他进(jìn )行报复(fù )，新一决定隐(yǐn )姓埋(mái )名，暗中追查(chá )他们(men )，希望能得到解药。一日，新一 的女友毛利兰来到了(le )阿笠博士的(de )家寻找男友的下(xià )落，被小兰(lán )撞见(jiàn )的新(xīn )一情急之(zhī )下编造(zào )了自己(jǐ )名叫江户川柯南，随后柯南寄居在了小(xiǎo )兰家。小兰的父亲毛(máo )利(lì )小(xiǎo )五(wǔ )郎是一名私家侦探，新一可(kě )以籍着和他一起(qǐ )四出办案一起追查黑夜人的下(xià )落。柯南在小学认识步美等小学生，他们一起组(zǔ )织(zhī )了(le )一个(gè )少年侦探团(tuán )，向罪犯(fàn )宣战！