工藤新一是全国(guó )著名的高中生侦探(tàn )，在一次追(zhuī )查黑衣人犯罪团伙(huǒ )时不幸被团伙成员发(fā )现，击晕后(hòu )喂了神奇的药水，工藤新一(yī )变(biàn )回了小孩！新一找(zhǎo )到(dào )了经(jīng )常帮助(zhù )他的(de )阿笠(lì )博士，博士为他度(dù )身打造不少间谍(dié )武器。为了防止犯罪(zuì )团(tuán )伙对他进行(háng )报复，新一决定隐姓埋名，暗中追查他们，希望(wàng )能(néng )得到解药。一日，新一 的女友毛(máo )利(lì )兰来到了阿笠博士的家寻找男友的下落，被小兰撞见的新一情急之下编造了自己名叫江户川柯(kē )南，随后柯南寄居在了小兰家。小(xiǎo )兰的(de )父亲毛利小五(wǔ )郎是一名私家侦(zhēn )探，新一可(kě )以籍(jí )着和(hé )他一起四出办案(àn )一起追查黑夜(yè )人的下落。柯南在小(xiǎo )学认识步美等小学(xué )生(shēng )，他们一(yī )起组织了一个少年侦探团，向罪犯宣战(zhàn )！