工藤新一是全国著(zhe )名的高中生侦探，在一(yī )次追查黑(hēi )衣人犯罪团伙时不幸被(bèi )团(tuán )伙(huǒ )成员发(fā )现，击晕后喂了神奇的(de )药水，工藤新一变回了小孩！新一找到了经常帮助他的阿笠博士，博士为他度(dù )身(shēn )打造(zào )不少间谍武器。为了防止犯罪团伙对他进行报复(fù )，新一决定隐姓埋名，暗中追查他(tā )们，希(xī )望能(néng )得到解药。一日，新一 的女友毛(máo )利兰来到了(le )阿笠博士(shì )的家寻找男友(yǒu )的下落，被小兰撞(zhuàng )见的新(xīn )一情急之下编造(zào )了(le )自己名(míng )叫(jiào )江户川柯南(nán )，随后柯(kē )南寄居在了小(xiǎo )兰家。小兰的父亲(qīn )毛利(lì )小五(wǔ )郎是一名私家侦探，新一可(kě )以(yǐ )籍着和他(tā )一起四出办案一起追查黑夜人(rén )的下落。柯(kē )南在小学认识步美等小学生，他(tā )们一起组织了一个少年侦探团，向罪(zuì )犯(fàn )宣战！