工(gōng )藤(téng )新一是全国著名的高中生侦探，在一次追查黑(hēi )衣人犯(fàn )罪团伙时不幸(xìng )被团伙(huǒ )成员发现，击晕后喂(wèi )了神奇的药水，工藤新(xīn )一变回了小孩！新一(yī )找到了经常帮(bāng )助他的阿笠博士，博士为(wéi )他度身打造(zào )不少间谍武器。为了(le )防止犯罪团(tuán )伙对他进(jìn )行报复，新一决定隐姓埋名，暗(àn )中追查他们，希望能得到解药。一日，新一 的女友毛(máo )利(lì )兰来到了阿笠博士的家寻找男友的下落(luò )，被小(xiǎo )兰撞见的新(xīn )一(yī )情急(jí )之下编造了自己名(míng )叫江(jiāng )户川(chuān )柯南，随后柯(kē )南寄居在了(le )小(xiǎo )兰家。小兰的父亲毛利小五郎是一名私家侦探，新(xīn )一可(kě )以籍着和他一起四出办案一起(qǐ )追(zhuī )查黑夜人的下落(luò )。柯南(nán )在小(xiǎo )学认识步美(měi )等小学生，他们一起组织了一个(gè )少年侦探团，向罪犯宣战！