工(gōng )藤新一是全国著名的高中生侦探(tàn )，在一次追查黑衣人犯(fàn )罪团伙时(shí )不幸被团伙(huǒ )成(chéng )员发现，击晕后喂了神奇的药水，工藤新(xīn )一(yī )变回了小孩！新一找到了经常帮(bāng )助(zhù )他的(de )阿笠博士，博士为他(tā )度身打造不少间谍武(wǔ )器。为了防止(zhǐ )犯(fàn )罪团伙对他进行报复，新一决定隐姓埋名，暗(àn )中追查他们，希望能得到解药。一(yī )日，新(xīn )一 的女友毛利兰来到了阿笠博士的家寻找(zhǎo )男(nán )友的下落，被小兰撞见的新一情急(jí )之下(xià )编造了自己(jǐ )名叫江户川(chuān )柯南，随后柯南(nán )寄(jì )居在了小兰家。小兰的父(fù )亲毛利小五郎是一(yī )名私家侦(zhēn )探，新一(yī )可以籍着和他一起四(sì )出办案一起追(zhuī )查黑夜人(rén )的下落(luò )。柯南在(zài )小学认识步(bù )美等小学(xué )生，他们一起组(zǔ )织了一个少(shǎo )年侦探(tàn )团，向罪犯宣战！