工藤新一(yī )是全国著名的高中生侦(zhēn )探，在一次追查(chá )黑衣人犯罪团伙时不(bú )幸(xìng )被团伙成员(yuán )发(fā )现，击晕后喂了神奇的药水，工藤新(xīn )一变回了小孩！新(xīn )一找到(dào )了经常帮助他的阿(ā )笠(lì )博士，博士为(wéi )他度身打造不少间谍武器。为(wéi )了防止(zhǐ )犯罪团伙对他进行报复(fù )，新一决(jué )定隐姓埋名，暗中(zhōng )追(zhuī )查他们，希望能得到解药。一日，新一(yī ) 的女友毛利兰来到(dào )了(le )阿笠(lì )博士的家寻(xún )找男友的下落(luò )，被小兰撞见的新一(yī )情急之下(xià )编(biān )造了(le )自(zì )己名叫江户川柯南，随后柯南寄居在了小兰家。小兰的父亲毛利小五郎是一名私家侦探，新(xīn )一可以籍着和他一起四出(chū )办案一(yī )起追(zhuī )查黑夜人的下落。柯(kē )南(nán )在小(xiǎo )学认识(shí )步美等小学生，他们一起组织了一个少年侦探团，向罪犯宣战！